Le Guide Suprême du régime iranien, Ali Khamenei, a publié une instruction aux responsables des trois branches du régime théocratique et aussi à Rafsanjani au sujet des élections. Cette instruction contient 18 paragraphes, mais sa partie la plus importante est le paragraphe 16 dans lequel Khamenei interdit aux forces militaires, du renseignement et de sécurité, l’entrée dans les « divisions politiques et électorales. »
Le paragraphe 16 définit les conditions des élections et stipule « Interdiction d’entrée des Forces armées et des trois branches, y compris les ministères et leurs organismes subordonnés, leurs services de renseignement et organisations de sécurité, les institutions et entreprises du gouvernement, ainsi que les institutions publiques, dans les clivages factionnels et politiques et la défense des candidats aux élections »
Cette déclaration a été publiée alors que les opposants ont critiqué de façon répétitive l’implication et l’interférence des institutions militaires et de sécurité comme les Gardiens de la révolution, les Bassidjis, et le ministère du Renseignement et de la sécurité, dans les élections, mais Khamenei jusqu’ici, avait toujours soutenu explicitement leur implication ou gardé le silence.
Le paragraphe 4 de l’instruction aborde les questions financières et souligne le besoin de « déterminer la portée et le type de dépenses et les sources licites et illicites des élections, ainsi que la transparence des ressources et dépenses des candidats aux élections et des groupes politiques. »
L’instruction souligne aussi le besoin de respecter la constitution et demande au Conseil des gardiens de la Constitution (d’être responsables et de) répondre par écrit (aux candidats) au sujet « des raisons de l’annulation des (votes) dans les élections et celles de la disqualification des candidats si ils le demandent. »
La performance du Conseil des gardiens de la Constitution dans le refus généralisé des candidats lors de diverses élections a toujours été critiquée.
Les observateurs politiques ont décrit l’instruction de Khamenei comme une mesure sans précédent pour maîtriser la crise interne du régime et pour faire face aux divisions au sein du système et au risque de soulèvements au cours du simulacre d’élections des mollahs en Iran.